Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPOPO43791 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPOPO43791 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPOPO43791 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPOPO43791 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPOPO43791 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOPO43791 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOPO43791 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOPO43791 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOPO43791 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPOPO43791 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPOPO43791 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPOPO43791 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPOPO43791 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOPO43791 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOPO43791 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOPO43791 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOPO43791 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPOPO43791 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPOPO43791 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPOPO43791 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOPO43791 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOPO43791 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPOPO43791 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPOPO43791 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPOPO43791 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPOPO43791 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPOPO43791 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPOPO43791 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPOPO43791 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOPO43791 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOPO43791 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPOPO43791 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPOPO43791 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPOPO43791 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOPO43791 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOPO43791 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPOPO43791 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPOPO43791 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOPO43791 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPOPO43791 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPOPO43791 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPOPO43791 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPOPO43791 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPOPO43791 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPOPO43791 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPOPO43791 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPOPO43791 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPOPO43791 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPOPO43791 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOPO43791 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPOPO43791 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPOPO43791 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOPO43791 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOPO43791 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOPO43791 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOPO43791 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPOPO43791 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPOPO43791 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOPO43791 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOPO43791 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOPO43791 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOPO43791 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPOPO43791 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOPO43791 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOPO43791 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOPO43791 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOPO43791 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPOPO43791 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOPO43791 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOPO43791 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms