Protein–RNA interactions for Protein: O15528

CYP27B1, 25-hydroxyvitamin D-1 alpha hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27B1O15528 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CYP27B1O15528 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CYP27B1O15528 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CYP27B1O15528 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CYP27B1O15528 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CYP27B1O15528 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CYP27B1O15528 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CYP27B1O15528 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CYP27B1O15528 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CYP27B1O15528 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CYP27B1O15528 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CYP27B1O15528 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CYP27B1O15528 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CYP27B1O15528 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CYP27B1O15528 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CYP27B1O15528 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CYP27B1O15528 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CYP27B1O15528 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CYP27B1O15528 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CYP27B1O15528 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CYP27B1O15528 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CYP27B1O15528 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms