Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCAMP3O14828 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAMP3O14828 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAMP3O14828 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAMP3O14828 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCAMP3O14828 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SCAMP3O14828 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SCAMP3O14828 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SCAMP3O14828 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SCAMP3O14828 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms