Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F3O00716 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F3O00716 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F3O00716 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
E2F3O00716 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
E2F3O00716 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F3O00716 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F3O00716 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F3O00716 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F3O00716 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
E2F3O00716 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F3O00716 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F3O00716 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
E2F3O00716 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
E2F3O00716 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F3O00716 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F3O00716 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
E2F3O00716 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F3O00716 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F3O00716 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
E2F3O00716 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F3O00716 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F3O00716 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
E2F3O00716 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
E2F3O00716 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
E2F3O00716 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F3O00716 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F3O00716 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F3O00716 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
E2F3O00716 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
E2F3O00716 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F3O00716 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F3O00716 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F3O00716 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
E2F3O00716 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F3O00716 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
E2F3O00716 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F3O00716 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F3O00716 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
E2F3O00716 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F3O00716 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
E2F3O00716 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F3O00716 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F3O00716 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F3O00716 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
E2F3O00716 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
E2F3O00716 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F3O00716 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F3O00716 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F3O00716 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
E2F3O00716 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F3O00716 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F3O00716 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F3O00716 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F3O00716 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
E2F3O00716 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F3O00716 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
E2F3O00716 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
E2F3O00716 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F3O00716 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F3O00716 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
E2F3O00716 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
E2F3O00716 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
E2F3O00716 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
E2F3O00716 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms