Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABARAPH6UMI1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABARAPH6UMI1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABARAPH6UMI1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABARAPH6UMI1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPH6UMI1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms