Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX16-NPEPL1H3BU86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX16-NPEPL1H3BU86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX16-NPEPL1H3BU86 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STX16-NPEPL1H3BU86 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms