Protein–RNA interactions for Protein: H3BQB6

STMND1, Stathmin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMND1H3BQB6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMND1H3BQB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STMND1H3BQB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMND1H3BQB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STMND1H3BQB6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMND1H3BQB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMND1H3BQB6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STMND1H3BQB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STMND1H3BQB6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STMND1H3BQB6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms