Protein–RNA interactions for Protein: H3BMG7

Transmembrane 9 superfamily member (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMG7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BMG7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BMG7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BMG7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
H3BMG7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BMG7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BMG7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
H3BMG7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BMG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BMG7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
H3BMG7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
H3BMG7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
H3BMG7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
H3BMG7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
H3BMG7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BMG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BMG7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BMG7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
H3BMG7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H3BMG7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BMG7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BMG7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BMG7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H3BMG7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3BMG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
H3BMG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BMG7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BMG7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BMG7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H3BMG7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H3BMG7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H3BMG7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BMG7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BMG7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BMG7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H3BMG7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H3BMG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H3BMG7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H3BMG7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H3BMG7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H3BMG7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
H3BMG7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H3BMG7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms