Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPIPA2E9PIF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPIPA2E9PIF3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NPIPA2E9PIF3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPIPA2E9PIF3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms