Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ11

PMS2P5, Postmeiotic segregation increased 2-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P5A8MQ11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PMS2P5A8MQ11 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PMS2P5A8MQ11 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMS2P5A8MQ11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMS2P5A8MQ11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
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