Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6BA6NDN3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6BA6NDN3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6BA6NDN3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6BA6NDN3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms