Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00862A6NCI5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00862A6NCI5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00862A6NCI5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00862A6NCI5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms