Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LCHNA4D1U4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LCHNA4D1U4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LCHNA4D1U4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LCHNA4D1U4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LCHNA4D1U4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LCHNA4D1U4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms