Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPED1A4D0V7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CPED1A4D0V7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPED1A4D0V7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPED1A4D0V7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPED1A4D0V7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CPED1A4D0V7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms