Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND3A2RUS2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND3A2RUS2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND3A2RUS2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DENND3A2RUS2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms