Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C9orf170A2RU37 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C9orf170A2RU37 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C9orf170A2RU37 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C9orf170A2RU37 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C9orf170A2RU37 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms