Protein–RNA interactions for Protein: A1L170

C1orf226, Uncharacterized protein C1orf226, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf226A1L170 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1orf226A1L170 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1orf226A1L170 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
C1orf226A1L170 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C1orf226A1L170 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms