Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C19orf12Q9NSK7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms