Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOMER3Q9NSC5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOMER3Q9NSC5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms