Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C6orf50Q9HD87 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C6orf50Q9HD87 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms