Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PBDC1Q9BVG4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms