Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC112Q8NEF3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms