Protein–RNA interactions for Protein: Q86UX7

FERMT3, Fermitin family homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERMT3Q86UX7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FERMT3Q86UX7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FERMT3Q86UX7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms