Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SFT2D3Q587I9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms