Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C5orf47Q569G3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms