Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF212Q495C1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms