Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNCBQ16143 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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