Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CUL4BQ13620 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CUL4BQ13620 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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