Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
STRN3Q13033 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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