Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GTF2BQ00403 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms