Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TYMSP04818 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TYMSP04818 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TYMSP04818 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms