Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLIN1O60240 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLIN1O60240 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms