Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP73A6NFT4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP73A6NFT4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms