Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG6Q9Y2V7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG6Q9Y2V7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms