Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMC3Q9UQE7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms