Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00527Q9UJ94 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00527Q9UJ94 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms