Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
AGMATQ9BSE5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AGMATQ9BSE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms