Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNHIT3Q15649 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNHIT3Q15649 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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