Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 526.31■■□□□ 1.83e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.84e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 525.89■■□□□ 1.744e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.644e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-215ENST00000585077 1139 ntTSL 225.24■■□□□ 1.634e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)25.16■■□□□ 1.624e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-212ENST00000582429 1824 ntTSL 224.79■■□□□ 1.564e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.524e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-210ENST00000581608 2387 ntTSL 224.16■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.464e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 323.52■■□□□ 1.363e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 223.41■■□□□ 1.343e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 523.09■■□□□ 1.293e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 522.66■■□□□ 1.223e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.144e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-213ENST00000583354 686 ntTSL 521.95■■□□□ 1.14e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.084e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.073e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.954e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.934e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 IDH1-206ENST00000451391 563 ntTSL 320.82■□□□□ 0.923e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 520.44■□□□□ 0.863e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 519.81■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 219.53■□□□□ 0.723e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 319.53■□□□□ 0.723e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 519.52■□□□□ 0.713e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-204ENST00000558394 550 ntTSL 419.39■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-208ENST00000560514 638 ntTSL 219.39■□□□□ 0.694e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.691e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.684e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-204ENST00000577733 5503 ntTSL 219.22■□□□□ 0.674e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-204ENST00000578130 853 ntTSL 218.41■□□□□ 0.544e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CCT7-209ENST00000473197 595 ntTSL 417.96■□□□□ 0.473e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 PCK2-204ENST00000557969 525 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.423e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CCT7-206ENST00000464397 583 ntTSL 217.64■□□□□ 0.413e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.43e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 FLCN-210ENST00000577591 296 ntTSL 217.1■□□□□ 0.334e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-208ENST00000414711 673 ntTSL 517.04■□□□□ 0.323e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 416.88■□□□□ 0.294e-6■□□□□ 8.2
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NOLC1Q14978 ASPSCR1-205ENST00000578236 3277 ntTSL 216.29■□□□□ 0.24e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-215ENST00000437100 826 ntTSL 516.17■□□□□ 0.183e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LRP10-204ENST00000551466 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.154e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LRP10-205ENST00000553002 1065 ntTSL 215.92■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 515.86■□□□□ 0.131e-14■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LAMB1-206ENST00000468518 595 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 IDH1-204ENST00000417583 702 ntTSL 415.46■□□□□ 0.073e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-206ENST00000412056 998 ntTSL 315.28■□□□□ 0.043e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.014e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 PCK2-207ENST00000559171 508 ntTSL 314.85□□□□□ -0.031e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HEXDC-205ENST00000578616 862 ntTSL 314.83□□□□□ -0.044e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 IDH1-207ENST00000462386 1614 ntTSL 214.12□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC13A5-201ENST00000293800 3176 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.273e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 IDH1-208ENST00000481557 556 ntTSL 213.33□□□□□ -0.283e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-218ENST00000439806 748 ntTSL 512.02□□□□□ -0.493e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 411.64□□□□□ -0.554e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CPNE1-214ENST00000435747 400 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 EEF2-203ENST00000596417 218 ntTSL 211.11□□□□□ -0.631e-15■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 AL109827.1-202ENST00000441563 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.96□□□□□ -0.653e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 AL109827.1-201ENST00000454607 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 210.96□□□□□ -0.653e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC13A5-209ENST00000574580 5398 nt10.84□□□□□ -0.673e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 LAMB1-210ENST00000474380 945 ntTSL 510.34□□□□□ -0.754e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ETFA-214ENST00000560345 717 ntTSL 49.43□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 DDB1-208ENST00000537120 1215 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ETFA-217ENST00000560816 412 ntTSL 38.34□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ETFA-210ENST00000559973 804 ntTSL 38.3□□□□□ -1.081e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ETFA-209ENST00000559758 893 ntTSL 27.84□□□□□ -1.151e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC38A2-202ENST00000546520 601 ntTSL 25.72□□□□□ -1.492e-10■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.641e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 35.37□□□□□ -1.551e-7■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC2A1-202ENST00000415851 578 ntTSL 220.38■□□□□ 0.859e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC2A1-206ENST00000625233 1031 ntTSL 219.51■□□□□ 0.719e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SLC2A1-201ENST00000372500 533 ntTSL 317.26■□□□□ 0.359e-13■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 KHDRBS1-203ENST00000484270 1989 ntTSL 521.96■■□□□ 1.111e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.051e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SEC61A1-201ENST00000243253 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SEC61A1-205ENST00000483956 3046 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.151e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 SEC61A1-202ENST00000424880 3238 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.21e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CFB-273ENST00000460718 768 ntTSL 512.53□□□□□ -0.47e-9■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 48.14□□□□□ -1.117e-9■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 RCCD1-205ENST00000556333 735 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.139e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.436e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.396e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.266e-6■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 AKT2-218ENST00000483166 4454 ntTSL 215.45■□□□□ 0.069e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 AKT2-216ENST00000476266 3309 ntTSL 515.35■□□□□ 0.059e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 RCCD1-209ENST00000557750 1696 ntTSL 313.37□□□□□ -0.279e-8■□□□□ 8.2
NOLC1Q14978 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.432e-7■□□□□ 8.1
NOLC1Q14978 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.772e-7■□□□□ 8.1
NOLC1Q14978 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.182e-7■□□□□ 8.1
NOLC1Q14978 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.141e-6■□□□□ 8.1
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