Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDX39BQ13838 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DDX39BQ13838 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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