Protein–RNA interactions for Protein: Q11206

ST3GAL4, CMP-N-acetylneuraminate-beta-galactosamide-alpha-2,3-sialyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST3GAL4Q11206 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ST3GAL4Q11206 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms