Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERV-K104P61576 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms