Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NUP214P35658 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NUP214P35658 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NUP214P35658 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NUP214P35658 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms