Protein–RNA interactions for Protein: O95857

TSPAN13, Tetraspanin-13, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13O95857 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TSPAN13O95857 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TSPAN13O95857 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TSPAN13O95857 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TSPAN13O95857 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TSPAN13O95857 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TSPAN13O95857 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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