Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 SNRPCP16-201ENST00000506029 210 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC091839.1-201ENST00000513087 269 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RPH3A-219ENST00000551052 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PDE6G-202ENST00000571004 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RN7SL664P-201ENST00000584239 305 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 H3F3B-204ENST00000586607 551 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 IGFL1P2-201ENST00000593820 330 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.71-201ENST00000612122 282 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 uc_338.3-201ENST00000613268 181 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ANKRD13C-201ENST00000262346 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC010487.3-201ENST00000634278 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PEX5L-209ENST00000468741 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AC040162.3-201ENST00000572067 3907 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZP2-203ENST00000574002 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RC3H2-202ENST00000357244 3991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 GPR107-202ENST00000372406 7353 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 NLRP12-201ENST00000324134 3801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 KANSL1-211ENST00000575318 4935 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RHOBTB2-205ENST00000519685 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 COL25A1-209ENST00000622134 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SYNJ2-201ENST00000355585 7378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SERPINB2-201ENST00000299502 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TCP10L-201ENST00000300258 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TCF4-224ENST00000564403 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CCSER1-209ENST00000509176 5847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TCF19-202ENST00000376257 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 DYRK1A-204ENST00000398960 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 LINC00967-202ENST00000517725 259 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 AC116914.1-201ENST00000575043 398 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 GPR176-202ENST00000543580 1755 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PTPN2-201ENST00000309660 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 EXD2-203ENST00000409018 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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HOXD11P31277 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ABCF2-202ENST00000287844 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 BTN2A3P-203ENST00000465856 2483 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL138889.1-203ENST00000530000 6593 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 YAF2-219ENST00000555248 5095 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 NLRC5-201ENST00000262510 6822 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ACBD5-204ENST00000375905 3848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 CTNNB1-204ENST00000405570 2513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 AL662907.2-201ENST00000624339 3448 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 MYH2-206ENST00000622564 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SEC16B-201ENST00000308284 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 SSBP3-AS1-201ENST00000361350 2624 ntBASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 KANSL2-201ENST00000420613 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 EPB41L1-205ENST00000373946 6327 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
HOXD11P31277 RNA5SP78-201ENST00000364622 118 ntBASIC10□□□□□ -0.81
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