RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361350.5

SSBP3-AS1-201, SSBP3 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SSBP3-AS1, Length 2,624 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.86■□□□□ 0.93
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.93■□□□□ 0.3
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.55■□□□□ 0.24
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.32■□□□□ 0.2
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 HRCP23327 699 aa16.23■□□□□ 0.19
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.01■□□□□ 0.15
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SMARCA4P51532 1647 aa15.99■□□□□ 0.15
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa15.94■□□□□ 0.14
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.83■□□□□ 0.13
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 SMARCA2P51531 1590 aa15.73■□□□□ 0.11
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ABCC8Q09428 1581 aa15.42■□□□□ 0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 EEA1Q15075 1411 aa15.34■□□□□ 0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.31■□□□□ 0.04
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.08■□□□□ 0
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NEUROD1Q13562 356 aa15□□□□□ -0.01
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.97□□□□□ -0.01
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 KIF27Q86VH2 1401 aa14.91□□□□□ -0.02
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa14.91□□□□□ -0.02
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PRXQ9BXM0 1461 aa14.9□□□□□ -0.02
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.88□□□□□ -0.03
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.88□□□□□ -0.03
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.86□□□□□ -0.03
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SSBP3-AS1-201ENST00000361350 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.82□□□□□ -0.04
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 TOPBP1Q92547 1522 aa14.77□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.77□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CUX2O14529 1486 aa14.77□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 NESP48681 1621 aa14.75□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.74□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.74□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 WDR97A6NE52 1622 aa14.71□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 IGF1RP08069 1367 aa14.71□□□□□ -0.05
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CUL7Q14999 1698 aa14.69□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa14.67□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 BCL11AQ9H165 835 aa14.66□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ARAP1Q96P48 1450 aa14.65□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.65□□□□□ -0.06
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.62□□□□□ -0.07
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.61□□□□□ -0.07
SSBP3-AS1-201ENST00000361350 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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