Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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HECTD4Q9Y4D8 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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HECTD4Q9Y4D8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HECTD4Q9Y4D8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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HECTD4Q9Y4D8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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HECTD4Q9Y4D8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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HECTD4Q9Y4D8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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HECTD4Q9Y4D8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HECTD4Q9Y4D8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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