Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
AP3M1Q9Y2T2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AP3M1Q9Y2T2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms