Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CMTM6Q9NX76 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms