Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH2B1Q9NRF2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH2B1Q9NRF2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms